云类[5]_圆环图教程

1。圆环的介绍和软件安装

圆环软件是一种常用的软件显示图片。在圆环内部连接被称为链接网络营销让?年代一起学习

1。圆环的介绍和软件安装

圆环软件是一种常用的软件显示图片。在圆环内部连接被称为链接主要是用于研究基因在基因组的复制和共线性。

2。运行圆环SEO关键词主要是用于研究基因在基因组的复制和共线性。

2。运行圆环需要在本地perl软件。检查方法是调用cmd然后输入perl-v。

3。输入的路径圆环/ bin和运行测试。模块

4。运行.circos模块检查你缺少什么模块并安装你所缺乏的。

5。测试运行圆环命令:.circos - h

2。介绍三个圆环

3的数据格式文件通常需要画画:

1。分析框类型的格式文件如下。内容包括标签(信息显示外圆)开始和结束位置颜色信息(在圆环chr1是常用的颜色也可以被定义为红色和其他颜色)。前两列是固定的。

颜色可以检查和gddiag选择的一部分。圆环png文件的文件夹。颜色如下:

2。链接关系数据包括3内容两条染色体地区这链接属性(颜色、厚度)格式如下:

第一行是解释为:hs1染色体1从465年到30596年那么hs2染色体2连接从114046768到114076456类型1(属性标签颜色厚度等)。

3。属性文件这个文件可以显示线性散射热点图、直方图、文本和其他信息。

第一行是解释为:染色体hs3从1到4属性是71(这一列可以宽度、颜色、文本等)。

3。圆环围绕配置文件

为了方便使用圆环的配置文件它往往是通过调用实现以外的其他配置文件的主要配置文件。常用的:表意文字。conf配置文件(染色体)的配置文件绘制染色体以及其他的链接配置文件配置文件的热图等等

:蜱虫。conf配置文件(勾)颜色。conf(颜色)字体。conf(字体)等经常发生了微妙的变化就使用默认配置文件提供的圆环软件。

1.圆环。配置文件:

2。表意文字。咖啡染色体配置文件:

3。链接。配置文件:这个文件

需要读取一个文本文件的链接上面的第二点介绍了文本文件格式circos.link.filter提供示例数据。txt:

此外有条件语句和indeogram文件的链接。例如下面的条件语句意味着如果hs1最后一列的id那么它的填充颜色是蓝色的和边框颜色也是蓝色的。

4。嘘。conf直方图和热图配置文件在这个时候你需要准备的直方图数据文件: