网站的结构分为两种类型一种是物理结构大致可视为网站的固定目录和内容注册的位置。一种是逻辑结构如何优化搜索引擎大致可视为网站的固定目录和内容注册的位置。一种是逻辑结构类似于一棵大树从主干道的分支分叉。一个好的网站逻辑结构应该是金字塔形的。不同的列和内容应该有指向主页的链接这样主页的权重会更高。
问题已经出现。许多网站遵循金字塔式的链接结构。然而主页上有一些不友好的链接损害了网站的搜索引擎优化如"主页"、"主页"、"联系我们"等。其目的是增强主页的重量。然而在主页上放置一些价值较低的页面有点不合适。
对于大型网站主张使用关键词作为锚文本指向位于非主要导航部分适当位置的主页如页面底部的版权声明等。事实上这种做法非常普遍例如在底部怎样建设网站在底部几个关键字链接如"搜索引擎优化教程"、"搜索引擎优化服务"、"搜索引擎优化培训"等被用来指向主页并可以在其他网站上看到。